木犀草素在自然界中分布广泛，因最初是从木犀草科（Resedaceae）木犀草属草本植物木犀草（ResedaodorataL.）的叶、茎、枝中分离出而得名，可从多种天然药材、蔬菜果实中分离得到。发现主要存在于金银花、菊花、荆芥、白毛夏枯草、洋蓟、紫苏属、黄芩属、裸花紫珠等天然药材中，以及芽甘蓝、洋白菜、菜花、甜菜、椰菜、胡萝卜、芹菜、甜椒、辣椒、落花生等蔬菜果实中，其它如橄榄油和红酒等植物产品以及野凤仙花、百里香草、唇形科植物全叶青兰草、筋骨草等也含有木犀草素。
除了从天然产物中提取外，也可以采用人工合成的方法获得木犀草素。
